Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT13P13646 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT13P13646 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT13P13646 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT13P13646 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT13P13646 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT13P13646 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT13P13646 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT13P13646 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms