Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB2P05107 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms