Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms