Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms