Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXNB1O43157 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXNB1O43157 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXNB1O43157 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXNB1O43157 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXNB1O43157 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXNB1O43157 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLXNB1O43157 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms