Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB6O15197 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms