Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms