Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms