Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y577

TRIM17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM17Q9Y577 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM17Q9Y577 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms