Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms