Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC25Q9NXE8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms