Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINM1Q9NU53 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms