Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAS3Q9H6U6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms