Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms