Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms