Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SIN3AQ96ST3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms