Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms