Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms