Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms