Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms