Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALKBH2Q6NS38 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms