Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRNL1Q5VV63 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms