Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXNQ16595 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXNQ16595 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXNQ16595 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXNQ16595 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms