Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF1AQ15573 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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