Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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