Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF1Q14162 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF1Q14162 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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