Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPAQ06546 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms