Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms