Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLTCQ00610 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms