Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX3P56589 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX3P56589 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX3P56589 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX3P56589 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX3P56589 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX3P56589 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX3P56589 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX3P56589 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX3P56589 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX3P56589 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX3P56589 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX3P56589 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX3P56589 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX3P56589 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX3P56589 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX3P56589 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX3P56589 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX3P56589 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX3P56589 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX3P56589 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX3P56589 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX3P56589 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX3P56589 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX3P56589 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX3P56589 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms