Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB2P47870 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB2P47870 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB2P47870 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB2P47870 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB2P47870 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB2P47870 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB2P47870 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB2P47870 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB2P47870 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB2P47870 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB2P47870 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms