Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms