Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCP2P22307 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCP2P22307 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCP2P22307 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCP2P22307 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCP2P22307 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCP2P22307 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2P22307 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2P22307 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2P22307 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2P22307 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2P22307 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2P22307 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2P22307 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2P22307 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2P22307 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2P22307 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2P22307 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCP2P22307 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCP2P22307 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCP2P22307 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCP2P22307 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCP2P22307 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCP2P22307 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCP2P22307 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCP2P22307 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms