Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC3P19447 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms