Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYN1P17600 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYN1P17600 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYN1P17600 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYN1P17600 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYN1P17600 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYN1P17600 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYN1P17600 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYN1P17600 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYN1P17600 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYN1P17600 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYN1P17600 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYN1P17600 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYN1P17600 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYN1P17600 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYN1P17600 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYN1P17600 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYN1P17600 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYN1P17600 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYN1P17600 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYN1P17600 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYN1P17600 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYN1P17600 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYN1P17600 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYN1P17600 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYN1P17600 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYN1P17600 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYN1P17600 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYN1P17600 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms