Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms