Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL11A1P12107 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms