Protein–RNA interactions for Protein: P09429

HMGB1, High mobility group protein B1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P09429 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P09429 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P09429 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms