Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms