Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT7O43581 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT7O43581 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT7O43581 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT7O43581 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT7O43581 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT7O43581 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms