Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdcbpO08992 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdcbpO08992 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdcbpO08992 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdcbpO08992 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdcbpO08992 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdcbpO08992 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdcbpO08992 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SdcbpO08992 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SdcbpO08992 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SdcbpO08992 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SdcbpO08992 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SdcbpO08992 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SdcbpO08992 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SdcbpO08992 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SdcbpO08992 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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