Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms