Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc166S4R181 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc166S4R181 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc166S4R181 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc166S4R181 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc166S4R181 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc166S4R181 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc166S4R181 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc166S4R181 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc166S4R181 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc166S4R181 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc166S4R181 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc166S4R181 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc166S4R181 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms