Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HnrnpcQ9Z204 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HnrnpcQ9Z204 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HnrnpcQ9Z204 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HnrnpcQ9Z204 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HnrnpcQ9Z204 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HnrnpcQ9Z204 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HnrnpcQ9Z204 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HnrnpcQ9Z204 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HnrnpcQ9Z204 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HnrnpcQ9Z204 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HnrnpcQ9Z204 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HnrnpcQ9Z204 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HnrnpcQ9Z204 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HnrnpcQ9Z204 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HnrnpcQ9Z204 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HnrnpcQ9Z204 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HnrnpcQ9Z204 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HnrnpcQ9Z204 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HnrnpcQ9Z204 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HnrnpcQ9Z204 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HnrnpcQ9Z204 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HnrnpcQ9Z204 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HnrnpcQ9Z204 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HnrnpcQ9Z204 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpcQ9Z204 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpcQ9Z204 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms