Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl8Q9Z121 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl8Q9Z121 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl8Q9Z121 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl8Q9Z121 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl8Q9Z121 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl8Q9Z121 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl8Q9Z121 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccl8Q9Z121 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccl8Q9Z121 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccl8Q9Z121 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl8Q9Z121 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccl8Q9Z121 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccl8Q9Z121 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl8Q9Z121 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl8Q9Z121 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms