Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUN8

Lbx2, Transcription factor LBX2, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx2Q9WUN8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lbx2Q9WUN8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lbx2Q9WUN8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lbx2Q9WUN8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lbx2Q9WUN8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lbx2Q9WUN8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lbx2Q9WUN8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lbx2Q9WUN8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lbx2Q9WUN8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lbx2Q9WUN8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lbx2Q9WUN8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lbx2Q9WUN8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lbx2Q9WUN8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lbx2Q9WUN8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms