Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn8aQ9WTU3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn8aQ9WTU3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn8aQ9WTU3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn8aQ9WTU3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn8aQ9WTU3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn8aQ9WTU3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn8aQ9WTU3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn8aQ9WTU3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn8aQ9WTU3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn8aQ9WTU3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn8aQ9WTU3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn8aQ9WTU3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Scn8aQ9WTU3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn8aQ9WTU3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn8aQ9WTU3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn8aQ9WTU3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn8aQ9WTU3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn8aQ9WTU3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn8aQ9WTU3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn8aQ9WTU3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn8aQ9WTU3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn8aQ9WTU3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn8aQ9WTU3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms