Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabrg1Q9R0Y8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabrg1Q9R0Y8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gabrg1Q9R0Y8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabrg1Q9R0Y8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabrg1Q9R0Y8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabrg1Q9R0Y8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabrg1Q9R0Y8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabrg1Q9R0Y8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabrg1Q9R0Y8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabrg1Q9R0Y8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabrg1Q9R0Y8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabrg1Q9R0Y8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabrg1Q9R0Y8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrg1Q9R0Y8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrg1Q9R0Y8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabrg1Q9R0Y8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabrg1Q9R0Y8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabrg1Q9R0Y8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabrg1Q9R0Y8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabrg1Q9R0Y8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabrg1Q9R0Y8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms