Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hsf4Q9R0L1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hsf4Q9R0L1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hsf4Q9R0L1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hsf4Q9R0L1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms