Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copg1Q9QZE5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Copg1Q9QZE5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Copg1Q9QZE5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copg1Q9QZE5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copg1Q9QZE5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms